Em documentos assinados pelo próprio Patriarca Fundador da Igreja Gnóstica Cristã Universal, Samael Aun Weor, estes são os objetivos e os princípios da Igreja Gnóstica:
1. Trabalhar pela dignificação do ser humano e pela revalorização dos princípios espirituais.
2. Fundamentar a divulgação do cristianismo antigo em sua forma gnóstica primogênita para o bem das almas.
3. Ensinar uma doutrina transcendental capaz de equilibrar de forma consciente o pensamento, o sentimento e a ação.
4. Dar a conhecer à humanidade o Cristo Íntimo.
5. Estabelecer de forma legal a Igreja Gnóstica para benefício próprio e de todos aqueles que vieram a participar de suas atividades religiosas.
6. Não interferir em assuntos políticos e governamentais dos países em que estiver instalada e colaborar na formação de cidadãos úteis à sociedade, à nação e a Deus.
7. Cultivar o respeito a todas as religiões, seitas, escolas e ordens espirituais.
8. Ensinar a tolerância religiosa para a convivência pacífica dos seres humanos, sem distinção de sexo, credo, raça, nacionalidade ou religião.
9. Trabalhar pela paz, pela fraternidade universal e pela integração dos seres humanos.
Autor: Venerável Mestre Samael Aun Weor